Index A | B | C | D | E | F | G | H | I | L | M | N | O | R | S | T | U | V | W | X A AnnCollection (class in anndata.experimental) anndata module AnnData (class in anndata) AnnLoader (class in anndata.experimental) append() (anndata.experimental.CSCDataset method) (anndata.experimental.CSRDataset method) attrs_keys (anndata.experimental.AnnCollection property) B backend (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) C chunk_X() (anndata.AnnData method) chunked_X() (anndata.AnnData method) concat() (in module anndata) concat_on_disk() (in module anndata.experimental) concatenate() (anndata.AnnData method) convert (anndata.experimental.AnnCollection property) copy() (anndata.AnnData method) CSCDataset (class in anndata.experimental) CSRDataset (class in anndata.experimental) D dtype (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) E encoding_type (anndata.experimental.IOSpec attribute) encoding_version (anndata.experimental.IOSpec attribute) F filename (anndata.AnnData property) format (anndata.experimental.CSCDataset attribute) (anndata.experimental.CSRDataset attribute) format_str (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) G group (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) H has_backed (anndata.experimental.AnnCollection property) I ImplicitModificationWarning indptr (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) IOSpec (class in anndata.experimental) is_view (anndata.AnnData property) isbacked (anndata.AnnData property) iterate_axis() (anndata.experimental.AnnCollection method) L layers (anndata.AnnData property) lazy_attr() (anndata.experimental.AnnCollection method) M module anndata N n_obs (anndata.AnnData property) (anndata.experimental.AnnCollection property) n_vars (anndata.AnnData property) (anndata.experimental.AnnCollection property) name (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) O obs (anndata.AnnData property) (anndata.experimental.AnnCollection property) obs_keys() (anndata.AnnData method) obs_names (anndata.AnnData property) obs_names_make_unique() (anndata.AnnData method) obs_vector() (anndata.AnnData method) obsm (anndata.AnnData property) (anndata.experimental.AnnCollection property) obsm_keys() (anndata.AnnData method) obsp (anndata.AnnData property) R raw (anndata.AnnData property) read_csv() (in module anndata) read_dispatched() (in module anndata.experimental) read_elem() (in module anndata.experimental) read_excel() (in module anndata) read_h5ad() (in module anndata) read_hdf() (in module anndata) read_loom() (in module anndata) read_mtx() (in module anndata) read_text() (in module anndata) read_umi_tools() (in module anndata) read_zarr() (in module anndata) rename_categories() (anndata.AnnData method) S shape (anndata.AnnData property) (anndata.experimental.AnnCollection property) (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) sparse_dataset() (in module anndata.experimental) strings_to_categoricals() (anndata.AnnData method) T T (anndata.AnnData property) to_adata() (anndata.experimental.AnnCollection method) to_df() (anndata.AnnData method) to_memory() (anndata.AnnData method) (anndata.experimental.CSCDataset method) (anndata.experimental.CSRDataset method) transpose() (anndata.AnnData method) U uns (anndata.AnnData property) uns_keys() (anndata.AnnData method) V value (anndata.experimental.CSCDataset property) (anndata.experimental.CSRDataset property) var (anndata.AnnData property) var_keys() (anndata.AnnData method) var_names (anndata.AnnData property) var_names_make_unique() (anndata.AnnData method) var_vector() (anndata.AnnData method) varm (anndata.AnnData property) varm_keys() (anndata.AnnData method) varp (anndata.AnnData property) W write() (anndata.AnnData method) write_csvs() (anndata.AnnData method) write_dispatched() (in module anndata.experimental) write_elem() (in module anndata.experimental) write_h5ad() (anndata.AnnData method) write_loom() (anndata.AnnData method) write_zarr() (anndata.AnnData method) X X (anndata.AnnData property)
