anndata
0.7.8
API
anndata.AnnData
anndata.AnnData.T
anndata.AnnData.X
anndata.AnnData.filename
anndata.AnnData.is_view
anndata.AnnData.isbacked
anndata.AnnData.layers
anndata.AnnData.n_obs
anndata.AnnData.n_vars
anndata.AnnData.obs
anndata.AnnData.obs_names
anndata.AnnData.obsm
anndata.AnnData.obsp
anndata.AnnData.raw
anndata.AnnData.shape
anndata.AnnData.uns
anndata.AnnData.var
anndata.AnnData.var_names
anndata.AnnData.varm
anndata.AnnData.varp
anndata.AnnData.chunk_X
anndata.AnnData.chunked_X
anndata.AnnData.concatenate
anndata.AnnData.copy
anndata.AnnData.obs_keys
anndata.AnnData.obs_names_make_unique
anndata.AnnData.obs_vector
anndata.AnnData.obsm_keys
anndata.AnnData.rename_categories
anndata.AnnData.strings_to_categoricals
anndata.AnnData.to_df
anndata.AnnData.to_memory
anndata.AnnData.transpose
anndata.AnnData.uns_keys
anndata.AnnData.var_keys
anndata.AnnData.var_names_make_unique
anndata.AnnData.var_vector
anndata.AnnData.varm_keys
anndata.AnnData.write
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_h5ad
anndata.AnnData.write_loom
anndata.AnnData.write_zarr
Combining
Reading
Writing
anndata.AnnData.write
anndata.AnnData.write_csvs
anndata.AnnData.write_loom
anndata.AnnData.write_zarr
Errors and warnings
Concatenation
On-disk format
Benchmarks
Release Notes
References
anndata
API
anndata.AnnData
anndata.AnnData.write_loom
Edit on GitHub
anndata.AnnData.write_loom
AnnData.
write_loom
(
filename
,
write_obsm_varm
=
False
)
Write
.loom
-formatted hdf5 file.
Parameters
filename
:
PathLike
The filename.