DOKK
/
manpages
/
debian 11
/ libbio-perl-perl
Pages:
Bio::Align::AlignI.3pm.en
Bio::Align::DNAStatistics.3pm.en
Bio::Align::PairwiseStatistics.3pm.en
Bio::Align::ProteinStatistics.3pm.en
Bio::Align::StatisticsI.3pm.en
Bio::Align::Utilities.3pm.en
Bio::AlignIO.3pm.en
Bio::AlignIO::Handler::GenericAlignHandler.3pm.en
Bio::AlignIO::arp.3pm.en
Bio::AlignIO::bl2seq.3pm.en
Bio::AlignIO::clustalw.3pm.en
Bio::AlignIO::emboss.3pm.en
Bio::AlignIO::fasta.3pm.en
Bio::AlignIO::largemultifasta.3pm.en
Bio::AlignIO::maf.3pm.en
Bio::AlignIO::mase.3pm.en
Bio::AlignIO::mega.3pm.en
Bio::AlignIO::meme.3pm.en
Bio::AlignIO::metafasta.3pm.en
Bio::AlignIO::msf.3pm.en
Bio::AlignIO::nexus.3pm.en
Bio::AlignIO::pfam.3pm.en
Bio::AlignIO::phylip.3pm.en
Bio::AlignIO::po.3pm.en
Bio::AlignIO::proda.3pm.en
Bio::AlignIO::prodom.3pm.en
Bio::AlignIO::psi.3pm.en
Bio::AlignIO::selex.3pm.en
Bio::AlignIO::xmfa.3pm.en
Bio::AnalysisI.3pm.en
Bio::AnalysisParserI.3pm.en
Bio::AnalysisResultI.3pm.en
Bio::AnnotatableI.3pm.en
Bio::Annotation::AnnotationFactory.3pm.en
Bio::Annotation::Collection.3pm.en
Bio::Annotation::Comment.3pm.en
Bio::Annotation::DBLink.3pm.en
Bio::Annotation::OntologyTerm.3pm.en
Bio::Annotation::Reference.3pm.en
Bio::Annotation::Relation.3pm.en
Bio::Annotation::SimpleValue.3pm.en
Bio::Annotation::StructuredValue.3pm.en
Bio::Annotation::TagTree.3pm.en
Bio::Annotation::Target.3pm.en
Bio::Annotation::Tree.3pm.en
Bio::Annotation::TypeManager.3pm.en
Bio::AnnotationCollectionI.3pm.en
Bio::AnnotationI.3pm.en
Bio::CodonUsage::IO.3pm.en
Bio::CodonUsage::Table.3pm.en
Bio::DB::DBFetch.3pm.en
Bio::DB::Failover.3pm.en
Bio::DB::Fasta.3pm.en
Bio::DB::FileCache.3pm.en
Bio::DB::Flat.3pm.en
Bio::DB::Flat::BDB.3pm.en
Bio::DB::Flat::BDB::embl.3pm.en
Bio::DB::Flat::BDB::fasta.3pm.en
Bio::DB::Flat::BDB::genbank.3pm.en
Bio::DB::Flat::BDB::swiss.3pm.en
Bio::DB::Flat::BinarySearch.3pm.en
Bio::DB::GFF::Util::Binning.3pm.en
Bio::DB::GFF::Util::Rearrange.3pm.en
Bio::DB::GenericWebAgent.3pm.en
Bio::DB::InMemoryCache.3pm.en
Bio::DB::IndexedBase.3pm.en
Bio::DB::LocationI.3pm.en
Bio::DB::Qual.3pm.en
Bio::DB::Query::WebQuery.3pm.en
Bio::DB::QueryI.3pm.en
Bio::DB::RandomAccessI.3pm.en
Bio::DB::ReferenceI.3pm.en
Bio::DB::Registry.3pm.en
Bio::DB::SeqI.3pm.en
Bio::DB::Taxonomy.3pm.en
Bio::DB::Taxonomy::flatfile.3pm.en
Bio::DB::Taxonomy::greengenes.3pm.en
Bio::DB::Taxonomy::list.3pm.en
Bio::DB::Taxonomy::silva.3pm.en
Bio::DB::UpdateableSeqI.3pm.en
Bio::DB::WebDBSeqI.3pm.en
Bio::DBLinkContainerI.3pm.en
Bio::Das::FeatureTypeI.3pm.en
Bio::Das::SegmentI.3pm.en
Bio::DasI.3pm.en
Bio::DescribableI.3pm.en
Bio::Event::EventGeneratorI.3pm.en
Bio::Event::EventHandlerI.3pm.en
Bio::Factory::AnalysisI.3pm.en
Bio::Factory::ApplicationFactoryI.3pm.en
Bio::Factory::DriverFactory.3pm.en
Bio::Factory::FTLocationFactory.3pm.en
Bio::Factory::LocationFactoryI.3pm.en
Bio::Factory::ObjectBuilderI.3pm.en
Bio::Factory::ObjectFactory.3pm.en
Bio::Factory::ObjectFactoryI.3pm.en
Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactory.3pm.en
Bio::Factory::SeqAnalysisParserFactoryI.3pm.en
Bio::Factory::SequenceFactoryI.3pm.en
Bio::Factory::SequenceProcessorI.3pm.en
Bio::Factory::SequenceStreamI.3pm.en
Bio::Factory::TreeFactoryI.3pm.en
Bio::FeatureHolderI.3pm.en
Bio::HandlerBaseI.3pm.en
Bio::IdCollectionI.3pm.en
Bio::IdentifiableI.3pm.en
Bio::Index::Abstract.3pm.en
Bio::Index::AbstractSeq.3pm.en
Bio::Index::Blast.3pm.en
Bio::Index::BlastTable.3pm.en
Bio::Index::EMBL.3pm.en
Bio::Index::Fasta.3pm.en
Bio::Index::Fastq.3pm.en
Bio::Index::GenBank.3pm.en
Bio::Index::Qual.3pm.en
Bio::Index::SwissPfam.3pm.en
Bio::Index::Swissprot.3pm.en
Bio::LocatableSeq.3pm.en
Bio::Location::Atomic.3pm.en
Bio::Location::AvWithinCoordPolicy.3pm.en
Bio::Location::CoordinatePolicyI.3pm.en
Bio::Location::Fuzzy.3pm.en
Bio::Location::FuzzyLocationI.3pm.en
Bio::Location::NarrowestCoordPolicy.3pm.en
Bio::Location::Simple.3pm.en
Bio::Location::Split.3pm.en
Bio::Location::SplitLocationI.3pm.en
Bio::Location::WidestCoordPolicy.3pm.en
Bio::LocationI.3pm.en
Bio::Matrix::Generic.3pm.en
Bio::Matrix::IO.3pm.en
Bio::Matrix::IO::mlagan.3pm.en
Bio::Matrix::IO::phylip.3pm.en
Bio::Matrix::IO::scoring.3pm.en
Bio::Matrix::MatrixI.3pm.en
Bio::Matrix::Mlagan.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO::mast.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO::masta.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO::meme.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO::psiblast.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::IO::transfac.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::InstanceSite.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::InstanceSiteI.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::ProtMatrix.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::ProtPsm.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::Psm.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::PsmHeader.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::PsmHeaderI.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::PsmI.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::SiteMatrix.3pm.en
Bio::Matrix::PSM::SiteMatrixI.3pm.en
Bio::Matrix::PhylipDist.3pm.en
Bio::Matrix::Scoring.3pm.en
Bio::Ontology::DocumentRegistry.3pm.en
Bio::Ontology::GOterm.3pm.en
Bio::Ontology::InterProTerm.3pm.en
Bio::Ontology::OBOEngine.3pm.en
Bio::Ontology::OBOterm.3pm.en
Bio::Ontology::Ontology.3pm.en
Bio::Ontology::OntologyEngineI.3pm.en
Bio::Ontology::OntologyI.3pm.en
Bio::Ontology::OntologyStore.3pm.en
Bio::Ontology::Path.3pm.en
Bio::Ontology::PathI.3pm.en
Bio::Ontology::Relationship.3pm.en
Bio::Ontology::RelationshipFactory.3pm.en
Bio::Ontology::RelationshipI.3pm.en
Bio::Ontology::RelationshipType.3pm.en
Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor.3pm.en
Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine.3pm.en
Bio::Ontology::Term.3pm.en
Bio::Ontology::TermFactory.3pm.en
Bio::Ontology::TermI.3pm.en
Bio::OntologyIO.3pm.en
Bio::OntologyIO::Handlers::BaseSAXHandler.3pm.en
Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler.3pm.en
Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler.3pm.en
Bio::OntologyIO::InterProParser.3pm.en
Bio::OntologyIO::dagflat.3pm.en
Bio::OntologyIO::goflat.3pm.en
Bio::OntologyIO::obo.3pm.en
Bio::OntologyIO::simplehierarchy.3pm.en
Bio::OntologyIO::soflat.3pm.en
Bio::ParameterBaseI.3pm.en
Bio::PrimarySeq.3pm.en
Bio::PrimarySeqI.3pm.en
Bio::PullParserI.3pm.en
Bio::Range.3pm.en
Bio::RangeI.3pm.en
Bio::Root::Exception.3pm.en
Bio::Root::HTTPget.3pm.en
Bio::Root::IO.3pm.en
Bio::Root::Root.3pm.en
Bio::Root::RootI.3pm.en
Bio::Root::Storable.3pm.en
Bio::Root::Test.3pm.en
Bio::Root::TestObject.3pm.en
Bio::Root::Utilities.3pm.en
Bio::Root::Version.3pm.en
Bio::Search::BlastStatistics.3pm.en
Bio::Search::BlastUtils.3pm.en
Bio::Search::DatabaseI.3pm.en
Bio::Search::GenericDatabase.3pm.en
Bio::Search::GenericStatistics.3pm.en
Bio::Search::HSP::BlastHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::BlastPullHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::FastaHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::GenericHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::HSPFactory.3pm.en
Bio::Search::HSP::HSPI.3pm.en
Bio::Search::HSP::ModelHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::PSLHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP.3pm.en
Bio::Search::HSP::PullHSPI.3pm.en
Bio::Search::HSP::WABAHSP.3pm.en
Bio::Search::Hit::BlastHit.3pm.en
Bio::Search::Hit::BlastPullHit.3pm.en
Bio::Search::Hit::Fasta.3pm.en
Bio::Search::Hit::GenericHit.3pm.en
Bio::Search::Hit::HitFactory.3pm.en
Bio::Search::Hit::HitI.3pm.en
Bio::Search::Hit::ModelHit.3pm.en
Bio::Search::Hit::PsiBlastHit.3pm.en
Bio::Search::Hit::PullHitI.3pm.en
Bio::Search::Iteration::GenericIteration.3pm.en
Bio::Search::Iteration::IterationI.3pm.en
Bio::Search::Processor.3pm.en
Bio::Search::Result::BlastPullResult.3pm.en
Bio::Search::Result::BlastResult.3pm.en
Bio::Search::Result::CrossMatchResult.3pm.en
Bio::Search::Result::GenericResult.3pm.en
Bio::Search::Result::INFERNALResult.3pm.en
Bio::Search::Result::PullResultI.3pm.en
Bio::Search::Result::ResultFactory.3pm.en
Bio::Search::Result::ResultI.3pm.en
Bio::Search::Result::WABAResult.3pm.en
Bio::Search::SearchUtils.3pm.en
Bio::Search::StatisticsI.3pm.en
Bio::Search::Tiling::MapTileUtils.3pm.en
Bio::Search::Tiling::MapTiling.3pm.en
Bio::Search::Tiling::TilingI.3pm.en
Bio::SearchIO.3pm.en
Bio::SearchIO::EventHandlerI.3pm.en
Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder.3pm.en
Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder.3pm.en
Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder.3pm.en
Bio::SearchIO::SearchWriterI.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter.3pm.en
Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter.3pm.en
Bio::SearchIO::axt.3pm.en
Bio::SearchIO::blast.3pm.en
Bio::SearchIO::blast_pull.3pm.en
Bio::SearchIO::blasttable.3pm.en
Bio::SearchIO::cross_match.3pm.en
Bio::SearchIO::erpin.3pm.en
Bio::SearchIO::exonerate.3pm.en
Bio::SearchIO::fasta.3pm.en
Bio::SearchIO::gmap_f9.3pm.en
Bio::SearchIO::infernal.3pm.en
Bio::SearchIO::megablast.3pm.en
Bio::SearchIO::psl.3pm.en
Bio::SearchIO::rnamotif.3pm.en
Bio::SearchIO::sim4.3pm.en
Bio::SearchIO::waba.3pm.en
Bio::SearchIO::wise.3pm.en
Bio::Seq.3pm.en
Bio::Seq::BaseSeqProcessor.3pm.en
Bio::Seq::EncodedSeq.3pm.en
Bio::Seq::LargeLocatableSeq.3pm.en
Bio::Seq::LargePrimarySeq.3pm.en
Bio::Seq::LargeSeq.3pm.en
Bio::Seq::LargeSeqI.3pm.en
Bio::Seq::Meta.3pm.en
Bio::Seq::Meta::Array.3pm.en
Bio::Seq::MetaI.3pm.en
Bio::Seq::PrimaryQual.3pm.en
Bio::Seq::PrimedSeq.3pm.en
Bio::Seq::QualI.3pm.en
Bio::Seq::Quality.3pm.en
Bio::Seq::RichSeq.3pm.en
Bio::Seq::RichSeqI.3pm.en
Bio::Seq::SeqBuilder.3pm.en
Bio::Seq::SeqFactory.3pm.en
Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory.3pm.en
Bio::Seq::SequenceTrace.3pm.en
Bio::Seq::SimulatedRead.3pm.en
Bio::Seq::TraceI.3pm.en
Bio::SeqAnalysisParserI.3pm.en
Bio::SeqFeature::Amplicon.3pm.en
Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor.3pm.en
Bio::SeqFeature::Collection.3pm.en
Bio::SeqFeature::CollectionI.3pm.en
Bio::SeqFeature::Computation.3pm.en
Bio::SeqFeature::FeaturePair.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::Exon.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::ExonI.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::Intron.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::Promoter.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::Transcript.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI.3pm.en
Bio::SeqFeature::Gene::UTR.3pm.en
Bio::SeqFeature::Generic.3pm.en
Bio::SeqFeature::Lite.3pm.en
Bio::SeqFeature::PositionProxy.3pm.en
Bio::SeqFeature::Primer.3pm.en
Bio::SeqFeature::Similarity.3pm.en
Bio::SeqFeature::SimilarityPair.3pm.en
Bio::SeqFeature::SubSeq.3pm.en
Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer.3pm.en
Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler.3pm.en
Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper.3pm.en
Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener.3pm.en
Bio::SeqFeature::TypedSeqFeatureI.3pm.en
Bio::SeqFeatureI.3pm.en
Bio::SeqI.3pm.en
Bio::SeqIO.3pm.en
Bio::SeqIO::FTHelper.3pm.en
Bio::SeqIO::Handler::GenericRichSeqHandler.3pm.en
Bio::SeqIO::MultiFile.3pm.en
Bio::SeqIO::ace.3pm.en
Bio::SeqIO::asciitree.3pm.en
Bio::SeqIO::bsml.3pm.en
Bio::SeqIO::bsml_sax.3pm.en
Bio::SeqIO::embl.3pm.en
Bio::SeqIO::embldriver.3pm.en
Bio::SeqIO::fasta.3pm.en
Bio::SeqIO::fastq.3pm.en
Bio::SeqIO::game.3pm.en
Bio::SeqIO::game::featHandler.3pm.en
Bio::SeqIO::game::gameHandler.3pm.en
Bio::SeqIO::game::gameSubs.3pm.en
Bio::SeqIO::game::gameWriter.3pm.en
Bio::SeqIO::game::seqHandler.3pm.en
Bio::SeqIO::gbdriver.3pm.en
Bio::SeqIO::gbxml.3pm.en
Bio::SeqIO::gcg.3pm.en
Bio::SeqIO::genbank.3pm.en
Bio::SeqIO::interpro.3pm.en
Bio::SeqIO::kegg.3pm.en
Bio::SeqIO::largefasta.3pm.en
Bio::SeqIO::locuslink.3pm.en
Bio::SeqIO::mbsout.3pm.en
Bio::SeqIO::metafasta.3pm.en
Bio::SeqIO::msout.3pm.en
Bio::SeqIO::phd.3pm.en
Bio::SeqIO::pir.3pm.en
Bio::SeqIO::qual.3pm.en
Bio::SeqIO::raw.3pm.en
Bio::SeqIO::scf.3pm.en
Bio::SeqIO::seqxml.3pm.en
Bio::SeqIO::swiss.3pm.en
Bio::SeqIO::swissdriver.3pm.en
Bio::SeqIO::tab.3pm.en
Bio::SeqIO::table.3pm.en
Bio::SeqIO::tigr.3pm.en
Bio::SeqIO::tigrxml.3pm.en
Bio::SeqIO::tinyseq.3pm.en
Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler.3pm.en
Bio::SeqUtils.3pm.en
Bio::SimpleAlign.3pm.en
Bio::SimpleAnalysisI.3pm.en
Bio::Species.3pm.en
Bio::Taxon.3pm.en
Bio::Tools::Alignment::Consed.3pm.en
Bio::Tools::Alignment::Trim.3pm.en
Bio::Tools::AmpliconSearch.3pm.en
Bio::Tools::Analysis::SimpleAnalysisBase.3pm.en
Bio::Tools::AnalysisResult.3pm.en
Bio::Tools::Blat.3pm.en
Bio::Tools::CodonTable.3pm.en
Bio::Tools::Coil.3pm.en
Bio::Tools::ECnumber.3pm.en
Bio::Tools::EMBOSS::Palindrome.3pm.en
Bio::Tools::EPCR.3pm.en
Bio::Tools::ESTScan.3pm.en
Bio::Tools::Eponine.3pm.en
Bio::Tools::Est2Genome.3pm.en
Bio::Tools::Fgenesh.3pm.en
Bio::Tools::FootPrinter.3pm.en
Bio::Tools::GFF.3pm.en
Bio::Tools::Geneid.3pm.en
Bio::Tools::Genemark.3pm.en
Bio::Tools::Genewise.3pm.en
Bio::Tools::Genomewise.3pm.en
Bio::Tools::Genscan.3pm.en
Bio::Tools::Glimmer.3pm.en
Bio::Tools::Grail.3pm.en
Bio::Tools::GuessSeqFormat.3pm.en
Bio::Tools::IUPAC.3pm.en
Bio::Tools::Lucy.3pm.en
Bio::Tools::MZEF.3pm.en
Bio::Tools::Match.3pm.en
Bio::Tools::OddCodes.3pm.en
Bio::Tools::Phylo::Gerp.3pm.en
Bio::Tools::Phylo::Molphy.3pm.en
Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result.3pm.en
Bio::Tools::Phylo::Phylip::ProtDist.3pm.en
Bio::Tools::Prediction::Exon.3pm.en
Bio::Tools::Prediction::Gene.3pm.en
Bio::Tools::Primer3.3pm.en
Bio::Tools::Primer::Assessor::Base.3pm.en
Bio::Tools::Primer::AssessorI.3pm.en
Bio::Tools::Primer::Feature.3pm.en
Bio::Tools::Primer::Pair.3pm.en
Bio::Tools::Prints.3pm.en
Bio::Tools::Profile.3pm.en
Bio::Tools::Promoterwise.3pm.en
Bio::Tools::PrositeScan.3pm.en
Bio::Tools::Pseudowise.3pm.en
Bio::Tools::QRNA.3pm.en
Bio::Tools::RandomDistFunctions.3pm.en
Bio::Tools::RepeatMasker.3pm.en
Bio::Tools::Run::Analysis.3pm.en
Bio::Tools::Run::AnalysisFactory.3pm.en
Bio::Tools::Run::GenericParameters.3pm.en
Bio::Tools::Run::ParametersI.3pm.en
Bio::Tools::Run::Phylo::PhyloBase.3pm.en
Bio::Tools::Run::WrapperBase.3pm.en
Bio::Tools::Run::WrapperBase::CommandExts.3pm.en
Bio::Tools::Seg.3pm.en
Bio::Tools::SeqPattern.3pm.en
Bio::Tools::SeqPattern::Backtranslate.3pm.en
Bio::Tools::SeqStats.3pm.en
Bio::Tools::SeqWords.3pm.en
Bio::Tools::Sigcleave.3pm.en
Bio::Tools::Signalp.3pm.en
Bio::Tools::Signalp::ExtendedSignalp.3pm.en
Bio::Tools::Sim4::Exon.3pm.en
Bio::Tools::Sim4::Results.3pm.en
Bio::Tools::Spidey::Exon.3pm.en
Bio::Tools::Spidey::Results.3pm.en
Bio::Tools::TandemRepeatsFinder.3pm.en
Bio::Tools::TargetP.3pm.en
Bio::Tools::Tmhmm.3pm.en
Bio::Tools::ipcress.3pm.en
Bio::Tools::isPcr.3pm.en
Bio::Tools::pICalculator.3pm.en
Bio::Tools::tRNAscanSE.3pm.en
Bio::Tree::AnnotatableNode.3pm.en
Bio::Tree::Compatible.3pm.en
Bio::Tree::DistanceFactory.3pm.en
Bio::Tree::Node.3pm.en
Bio::Tree::NodeI.3pm.en
Bio::Tree::NodeNHX.3pm.en
Bio::Tree::RandomFactory.3pm.en
Bio::Tree::Statistics.3pm.en
Bio::Tree::Tree.3pm.en
Bio::Tree::TreeFunctionsI.3pm.en
Bio::Tree::TreeI.3pm.en
Bio::TreeIO.3pm.en
Bio::TreeIO::NewickParser.3pm.en
Bio::TreeIO::TreeEventBuilder.3pm.en
Bio::TreeIO::cluster.3pm.en
Bio::TreeIO::lintree.3pm.en
Bio::TreeIO::newick.3pm.en
Bio::TreeIO::nexus.3pm.en
Bio::TreeIO::nhx.3pm.en
Bio::TreeIO::pag.3pm.en
Bio::TreeIO::phyloxml.3pm.en
Bio::TreeIO::tabtree.3pm.en
Bio::UpdateableSeqI.3pm.en
Bio::WebAgent.3pm.en
BioPerl.3pm.en